潜伏期为接触病原后3天～3周，平均7～10天，临床经过分为三期：

(1)早期生殖器初疹  原发性损害为生殖器部位发生细小的水疱或丘疹。皮损常为单个，无明显症状，数日自愈，不留瘢痕。女性及同性恋患者亦可发生于肛门、直肠、口腔、手指等处。初疹往往不被注意，尤其是女性发觉初疹更罕见。

(2)中期淋巴结病   初疹出现后1～4周发展为第2期。为腹股沟淋巴结病。2/3男性患者出现单侧淋巴结肿大，开始侵犯1～2个淋巴结，后侵犯多个，有疼痛、压痛，并与周围组织粘连成块状，皮肤表面呈紫红色，称为“第四性病横痃”。肿大的淋巴结被腹股沟韧带上下分开而形成“沟槽症”有诊断意义。数周后淋巴结破溃，排出黄色脓液，并形成许多瘘管，似“喷水壶状“。愈后留有瘢痕，亦不可化脓而自然吸收消退。

女性生殖器部位淋巴结引流与男性不同，除外阴部及阴道下段引流于腹沟淋巴结外，阴道上2/3段及宫颈有许多交通支直接与直肠周围淋巴结组织相同。故病变可累及直肠引起直肠炎与直肠周围炎，即“生殖器肛门直肠综合征“。表现为里急后重、腹痛、腹泻、大便带血、便秘和腹泻交替发生。直肠镜检可发现直肠炎症。

(3)晚期生殖象皮肿和直肠狭窄   (1)生殖器象皮肿：经数年或十几年长期慢性腹股沟淋巴管炎，淋巴回流障碍，女性患者出现阴唇象皮肿，逻辑性多发生于阴茎和阴囊。呈坚突肿胀肥厚，表面可发生疣状增殖及息肉。也可有直肠炎及直肠周围炎症使直肠狭窄，逐渐产生排便困难，粪便呈细条状，直肠指检肠壁变厚，肠道狭窄，有数量不等坚实肿块，常误诊为癌肿，应注意鉴别。